Ovaj sektor je organizovan u dva odsjeka:

U okviru Odsjeka za računovodstvo obavljaju se analitički i drugi stručni poslovi, i to:

• izrada računovodstvenih procedura i politika
• osiguranje finansijske i računovodstvene kontrole nad poslovnim promjenama u ISFU
• priprema prijedloga izmjene kontnog plana i budžetske klasifikacije
• ažuriranje i vođenje registra budžetskih korisnika,
• koordinacija računovodstvenih poslova i dnevnih operacija sistema sa ostalim operativnim centrima i korisnicima koje Trezor opslužuje,
• pregled dokumentacije s aspekta potpunosti i zakonitosti,
• obezbjeđenje poštivanja računovodstvenih standarda u svim segmentima rada odsjeka,
• unos i knjiženje podataka korisnika nabavke, korisnika obaveze, korisnika glavne knjige i potraživanja,
• stalna saradnja sa drugim operativnim centrima na kojima su instalisane radne stanice,
• izrada periodičnih i završnih obračuna,
• izrada periodičnih izvještaja i godišnjih konsolidovanih izvještaja, kao i izvještaja po zahtjevu Federalnoh ministarstva finansija,
• praćenje realizacije stambenih kredita i kredita za zapošljavanje iz sredstava privatizacije, saradnja sa bankama na području Zeničko-dobojskog kantona u oblasti kredita, priprema analiza i izvještaja o kreditima.

U okviru Odsjeka za planiranje i izvršenje budžeta obavljaju se upravni, analitički i drugi stručni poslovi, i to:

• izrada budžeta,
• izrada analiza, izvještaja, informacija i drugih stručnih materijala na bazi podataka iz oblasti prihoda,
• izrada periodičnih i godišnjih izvještaja o izvršenju budžeta,
• predlaganje mjera za ograničenje budžetske potrošnje,
• priprema procedura za izradu mjesečnih operativnih planova,
• koordinacija i održavanje odnosa sa bankama,
• priprema prognoza novčanih tokova u modulu za gotovinsko poravnanje,
• praćenje priliva i odliva sredstava na i sa JRT,
• izrada analiza i izvještaja o planiranju i upravljanju gotovinom,
• izvršavanje pripremljenih i odobrenih registara za plaćanje u skladu sa raspoloživim sredstvima i utvrđenim prioritetima,
• obavještavanje korisnika o statusu plaćanja,
• dnevna raspodjela prihoda (RAS datoteka), te povrat pogrešno ili više uplaćenih prihoda.